En este museo se pueden encontrar exhibiciones arqueológicas, culturales, militares y de vida silvestre.
Se realizan eventos como inauguraciones de exposiciones, conciertos y exposiciones temporales de piezas precolombinas.
Recientemente se han presentado nuevas especies de plantas descubiertas por el Botánico del Museo Nacional, así como el rescate de una esfera de piedra en el río Changuena.
Este museo tiene en marcha un proyecto para construir nuevas edificaciones que unificarían las colecciones de Historia Natural, lo que serían dos edificios en el Complejo de investigación y cultura.
Este museo se encuentra ubicado en las Avenidas Central y Segunda, contiguo a la Plaza de la Democracia y la Abolición del Ejército, en San José, Costa Rica.